Concordancia entre la prueba de antígenos rápida para SARS-CoV-2 y la prueba diagnóstica de RT-qPCR

Contenido principal del artículo

Antonio Barrios-Pérez
Ivette Cid-Oros
Carlos Becerril-Gutiérrez
Oswaldo S. Medina-Gómez

Resumen

Objetivo: estimar la concordancia de la prueba de antígenos rápida (PAR) para SARS-CoV-2 y la prueba de reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa con transcripción inversa (RT-qPCR). Métodos: estudio transversal analítico, realizado en tres unidades médicas del 1 de enero de 2021 al 30 de junio de 2022 en la Ciudad de México, México. Se realizó muestreo no probabilístico utilizando los datos del Sistema de Notificación en Línea para la Vigilancia Epidemiológica. El análisis de datos se realizó con medidas de frecuencia, índice de kappa de Cohen e índice de máxima verosimilitud. Resultados: de 2173 participantes con ambas pruebas diagnósticas: 565 muestras respiratorias fueron concordantes con resultado positivo (26.09% IC95% 24.25 – 27.99%) y 1229 con resultado negativo (56.55% IC95% 54.44 – 58.65%). Se estimó que la sensibilidad de la par frente a RT-qPCR fue de 65.17% (IC95% 61.99 – 68.33%) mientras que la especificidad fue de 94.10% (IC 95% 92.82 – 95.38%); un valor predictivo positivo de 88.01% (IC95% 85.23 – 90.41%) y valor predictivo negativo de 80.27% (IC95% 78.19 – 82.24%). El índice de kappa de Cohen fue de 0.62 (concordancia sustancial) y una razón de verosimilitud calculada de 40% ante una prevalencia preprueba, se observó una probabilidad posprueba del 88.3% para un resultado positivo con PAR en caso de tener la COVID-19. Conclusión: el presente estudio reveló una concordancia sustancial entre PAR y RT-qPCR, lo que respalda la viabilidad del uso de ambas pruebas. Esto proporciona a los clínicos una herramienta valiosa para la toma de decisiones informadas en el contexto diagnóstico de la COVID-19. 

Descargas

Los datos de descargas todavía no están disponibles.

Detalles del artículo

Cómo citar
Barrios-Pérez, A., Cid-Oros, I., Becerril-Gutiérrez, C., & Medina-Gómez, O. S. (2024). Concordancia entre la prueba de antígenos rápida para SARS-CoV-2 y la prueba diagnóstica de RT-qPCR. Atención Familiar, 25(2), 62–67. https://doi.org/10.22201/fm.14058871p.2024.287946

Citas

The Lancet editorial board. COVID-19 in Latin America—emergency and opportunity. The Lancet. 2021;398(10295):93.

Remes‐Troche JM, Velarde‐Ruiz Velasco JA. The Liver and COVID‐19 in Mexico. Clin Liver Dis. 2022;19(2):49-52.

Garduño-Orbe B, Sánchez-Rebolledo JM, Cortés-Rafael M, García-Jiménez Y, Perez-Ortiz M, Mendiola-Pastrana IR, et al. SARS-CoV-2 Reinfection among Healthcare Workers in Mexico: Case Report and Literature Review. Medicina (Kaunas). 2021 May 3;57(5):442.

Miller TE, Garcia Beltran WF, Bard AZ, Gogakos T, Anahtar MN, Astudillo MG, et al. Clinical sensitivity and interpretation of PCR and serological COVID‐19 diagnostics for patients presenting to the hospital. FASEB J. 2020;34(10):13877-13884.

Kumar A, Singh R, Kaur J, Pandey S, Sharma V, Thakur L, et al. Wuhan to World: The COVID-19 Pandemic. Front Cell Infect Microbiol. 2021;11:596201.

Sule WF, Oluwayelu DO. Real-time RT-PCR for COVID-19 diagnosis: challenges and prospects. Pan Afr Med J. 2020;35(Suppl 2):121.

Weitzel T, Legarraga P, Iruretagoyena M, Pizarro G, Vollrath V, Araos R, et al. Comparative evaluation of four rapid SARS-CoV-2 antigen detection tests using universal transport medium. Travel Med Infect Dis. 2021;39:101942.

Gohl DM, Garbe J, Grady P, Daniel J, Watson RHB, Auch B, et al. A rapid, cost-effective tailed amplicon method for sequencing SARS-CoV-2. BMC Genomics. 2020;21(1):863.

Albert E, Torres I, Bueno F, Huntley D, Molla E, Fernández-Fuentes MÁ, et al. Field evaluation of a rapid antigen test (PanbioTM COVID-19 Ag Rapid Test Device) for COVID-19 diagnosis in primary healthcare centres. Clin Microbiol Infect. 2021;27(3):472.e7-472.e10.

Osterman A, Badell I, Basara E, Stern M, Kriesel F, Eletreby M, et al. Impaired detection of omicron by SARS-CoV-2 rapid antigen tests. Med Microbiol Immunol (Berl). 2022;211(2-3):105-117.

Yamayoshi S, Sakai-Tagawa Y, Koga M, Akasaka O, Nakachi I, Koh H, et al. Comparison of Rapid Antigen Tests for COVID-19. Viruses. 2020;12(12):1420.

Landis JR, Koch GG. The Measurement of Observer Agreement for Categorical Data. Biometrics. 1977;33(1):159-174.

Deeks JJ, Altman DG. Diagnostic tests 4: likelihood ratios. BMJ. 2004;329(7458):168-169.

Peckham H, De Gruijter NM, Raine C, Radziszewska A, Ciurtin C, Wedderburn LR, et al. Male sex identified by global COVID-19 meta-analysis as a risk factor for death and ITU admission. Nat Commun. 2020;11(1):6317.

COVID-19 Tablero México. COVID - 19 Tablero México. [Internet]. [Citado 2024 Ene 15]. Disponible en: https://datos.covid-19.conacyt.mx/

Bongolan VP, Minoza JMA, De Castro R, Sevilleja JE. Age-Stratified Infection Probabilities Combined With a Quarantine-Modified Model for COVID-19 Needs Assessments: Model Development Study. J Med Internet Res. 2021;23(5):e19544.

Ren SY, Wang WB, Gao RD, Zhou AM. Omicron variant (B.1.1.529) of SARS-CoV-2: Mutation, infectivity, transmission, and vaccine resistance. World J Clin Cases. 2022;10(1):1-11.

Chams N, Chams S, Badran R, Shams A, Araji A, Raad M, Mukhopadhyay S, et al. COVID-19: A Multidisciplinary Review. Front Public Health. 2020;8:383.

Huang C, Wang Y, Li X, Ren L, Zhao J, Hu Y, et al. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. The Lancet. 2020;395(10223):497-506.

Iser BPM, Sliva I, Raymundo VT, Poleto MB, Schuelter-Trevisol F, Bobinski F. Definição de caso suspeito da COVID-19: uma revisão narrativa dos sinais e sintomas mais frequentes entre os casos confirmados. Epidemiol E Serviços Saúde. 2020;29(3).

Khalid MF, Selvam K, Jeffry AJN, Salmi MF, Najib MA, Norhayati MN, et al. Performance of Rapid Antigen Tests for COVID-19 Diagnosis: A Systematic Review and Meta-Analysis. Diagnostics. 2022;12(1):110.

Porte L, Legarraga P, Vollrath V, Aguilera X, Munita JM, Araos R, et al. Evaluation of a novel antigen-based rapid detection test for the diagnosis of SARS-CoV-2 in respiratory samples. Int J Infect Dis. 2020;99:328-333.

Berger A, Nsoga MTN, Perez-Rodriguez FJ, Aad YA, Sattonnet-Roche P, Gayet-Ageron A, et al. Diagnostic accuracy of two commercial SARSCoV- 2 antigen-detecting rapid tests at the point of care in community-based testing centers. PLoS ONE. 2021;16(3 March 2021):1-12.

Lippi G, Henry BM, Plebani M. LumiraDX SARS-CoV-2 Antigen Test for Diagnosing Acute SARS-CoV-2 Infection: Critical Literature Review and Meta-Analysis. Diagnostics. 2022;12(4):947.

Pandey AK, Mohanty A, Hada V, Rath RS, Kumar S, Kishore S, et al. Comparison of the Rapid Antigen Testing Method With RT-qPCR for the Diagnosis of COVID-19. Cureus. 2021;13(8).

Dinnes J, Deeks JJ, Berhane S, van Wyk SS, Nyaaba N, Domen J, et al. Rapid, point-of-care antigen tests for diagnosis of SARS-CoV-2 infection. Cochrane Infectious Diseases Group, ed. Cochrane Database Syst Rev. 2021;2022(7).